“กระบี่เย้ยยุทธจักร 2” (หม่าจิงเทา) เล่าเรื่องราวที่เต็มไปด้วยความซับซ้อนและการเปลี่ยนแปลงในยุทธจักร หลังจากที่สำนักคุ้มกันภัยบุญบารมีถูกกวาดล้าง มีเพียง “หลินผิงจือ” ลูกชายเจ้าสำนักเพียงคนเดียวที่รอดชีวิต เขาได้รับการช่วยเหลือจาก “เยวี่ยปู้ฉิง” เจ้าสำนักหัวซาน และถูกรับเป็นศิษย์
ในขณะเดียวกัน “เล่งฮู้ชง” ศิษย์คนโตของสำนักหัวซาน ได้เดินทางไปร่วมพิธีล้างมือในอ่างทองคำของ “หลิวเจิ้งฟง” แต่กลับพบกับเหตุการณ์ไม่คาดฝันเมื่อหลิวเจิ้งฟงถูกกล่าวหาว่าเป็นสหายกับ “ชีหยาง” สมาชิกของพรรคมาร ทั้งสองถูกบีบให้หลบหนีจากความเข้าใจผิดของผู้คนในยุทธจักร
แท้จริงแล้ว หลิวเจิ้งฟงและชีหยางไม่ได้เป็นศัตรู แต่เป็นเพื่อนสนิทที่มีความหลงใหลในดนตรีเช่นเดียวกัน พวกเขาได้ร่วมกันแต่งเพลง “เย้ยยุทธจักร” ขึ้นมาเพื่อสะท้อนถึงอิสระและความเป็นมิตรในยุทธจักร ก่อนที่จะเสียชีวิต ทั้งสองได้มอบสมุดโน้ตเพลงให้กับเล่งฮู้ชง แต่การที่เล่งฮู้ชงพกสมุดโน้ตเพลงนี้กลับทำให้เขาถูกเข้าใจผิดว่าเป็นคัมภีร์กระบี่ล้ำค่า และยังถูกกล่าวหาว่าเป็นศิษย์ทรยศของสำนักหัวซาน